Anulowanie faktury nie jest regulowane w przepisach prawa, ani rangi ustawowej, ani w aktach wykonawczych. Cz?sto jest mylone z korekt? faktury, cho? nie s? to poj?cia to?same. Jest jednak dopuszczalne zarówno przez organy podatkowe, jak i znajduje swoje oparcie w orzecznictwie s?dowym. W praktyce obrotu przyjmuje si?, ?e poprzez anulowanie wy??cza si? skutki prawnopodatkowe faktury co oznacza w skrócie przywrócenie stanu sprzed jej wystawienia. Anulowana faktura nie generuje zatem ju? obowi?zków podatkowych, ani te? ?adnych innych skutków prawnych.
Faktur? mo?na anulowa? w sytuacji, gdy zamówienie, na podstawie którego j? wystawiono, zosta?o anulowane, a wi?c nie zaistnia? obowi?zek podatkowy. Podobnie b?dzie wygl?da? przypadek, gdy w fakturze omy?kowo wpisano towar, którego nie zamawiano lub us?ug?, której nie wykonano, przez co faktura dokumentuje transakcj?, która nie mia?a miejsca. Najcz?stsz? praktyk? w takich przypadkach jest fizyczne zniszczenie faktury podlegaj?cej anulowaniu (i jej kopii) oraz wystawienie kolejnej, o tym samym numerze. Mo?na te? spi?? faktur? i jej kopi? do??czaj?c opis przyczyn, dla których faktura podlega?a anulowaniu. Mo?na je równie? przekre?li?. Dwóch ostatnich czynno?ci dokonuje si?, je?eli po wystawieniu faktury, która podlega anulowaniu, wystawiono faktury o kolejnych numerach. Wtedy dla celów dowodowych i ewentualnych wyja?nie? przed organem podatkowym warto posiada? takie dokumenty. Mo?na równie? na takich dokumentach umie?ci? oznaczenie anulowana.
Co jednak najistotniejsze, faktur? mo?na anulowa? je?li spe?nia ona dwa warunki: po pierwsze gdy dokumentuje ona czynno??, która nie zosta?a dokonana, co opisano powy?ej.Po drugie natomiast faktura taka nie mog?a zosta?? wprowadzona do obrotu, czyli na przyk?ad wys?ana lub przekazana kontrahentowi. W doktynie i orzecznictwie nie ma zgodno?ci, czy o?na tego dokona? równie?, gdy podatnik nie dysponuje orygina?em faktury (np. w sytuacji, gdy przesy?ka towaru z do??czon? faktur? zagin??a). Warto jednak wówczas udokumentowa? zagini?cie faktury dla celów dowodowych. Je?eli faktura, która powinna podlega? anulowaniu, zosta?a dor?czona nabywcy (czyli wprowadzono j? do obrotu), to zgodnie z przepisami, nie ma ju? mo?liwo?ci jej anulowania. W razie zaistnienia przes?anek trzeba j? wówczas skorygowa? poprzez wystawienie faktury koryguj?cej sprowadzj?c do zera, jak mówi si? w ?argonie ksi?gowym. Mo?na tego dokona?, gdy faktycznie nie dosz?o do transakcji, nie w przypadku rabatu, czy podwy?szenia ceny.
Je?li anulowana faktura VAT zosta?a uj?ta w deklaracji VAT za jaki? okres rozliczeniowy, to nale?y z?o?y? korekt? deklaracji VAT za okres wystawienia anulowanej faktury, przez co obni?a si? obrót, a tym samym nale?ny podatek. To ró?ni korekt? deklaracji w przypadku anulowania faktury od korekty deklaracji w przypadku korekty samej faktury. W tym ostatnim przypadku bowiem obni?enia VAT dokonuje si? dopiero w deklaracji dotycz?cej okresu rozliczeniowego, w jakim podatnik otrzyma? potwierdzenie odbioru faktury koryguj?cej przez kontrahenta.